Gli attacchi all'evoluzione da parte di credenti religiosi conservatori spesso includono l'affermazione secondo cui non esistono prove concrete che l'evoluzione si sia mai verificata. Molte persone sono influenzate da tali affermazioni, in parte perché mentre l'affermazione può essere fatta in modo drammatico e con facilità, le confutazioni sono necessariamente dispendiose in termini di tempo, accademiche e molto meno drammatiche. La verità, tuttavia, è che esistono prove abbondanti per l'evoluzione. La differenza tra strutture analoghe e omologhe offre agli atei (e ai teisti che accettano l'evoluzione) un modo interessante per descrivere le prove dell'evoluzione provenienti da due direzioni.
Strutture analoghe / convergenti
Alcune caratteristiche biologiche sono analoghe (anche chiamate "convergenti"), il che significa che svolgono la stessa funzione in specie diverse ma si sono evolute indipendentemente piuttosto che dallo stesso materiale embriologico o dalle stesse strutture in un antenato comune. Un esempio di una struttura analoga sarebbero le ali su farfalle, pipistrelli e uccelli.
Un altro esempio importante sarebbe lo sviluppo di un occhio di tipo fotocamera sia nei molluschi che nei vertebrati. Questo esempio di strutture analoghe è particolarmente utile perché una delle più comuni affermazioni fatte dai creazionisti religiosi è che qualcosa di così complesso come un occhio non avrebbe potuto evolversi naturalmente - insistono sul fatto che l'unica spiegazione praticabile è un designer soprannaturale (che è sempre il loro dio, anche se raramente lo ammettono apertamente).
Il fatto che gli occhi in diverse specie siano strutture analoghe dimostra non solo che l'occhio potrebbe evolversi naturalmente, ma che, di fatto, si è evoluto più volte, indipendentemente e in modi leggermente diversi. Lo stesso vale anche per altre strutture analoghe, e questo perché certe funzioni (come essere in grado di vedere) sono così utili che è inevitabile che alla fine si evolveranno. Nessun essere soprannaturale, che sia o meno un dio, è necessario per spiegare o capire come gli occhi si sono evoluti più volte.
Strutture omologhe
Le strutture omologhe, d'altra parte, sono caratteristiche che sono condivise da specie correlate perché sono state ereditate in qualche modo da un antenato comune. Ad esempio, le ossa sulle pinne anteriori di una balena sono omologhe alle ossa di un braccio umano ed entrambe sono omologhe alle ossa di un braccio di scimpanzé. Le ossa in tutte queste diverse parti del corpo su diversi animali sono sostanzialmente le stesse ossa, ma le loro dimensioni sono diverse e svolgono funzioni leggermente diverse negli animali in cui si trovano.
Le strutture omologhe forniscono prove dell'evoluzione perché consentono ai biologi di tracciare il percorso evolutivo di diverse specie, collegandole all'albero evolutivo più grande che collega tutta la vita a un antenato comune. Tali strutture sono anche una forte prova contro il creazionismo e il design intelligente: se ci fosse una divinità che ha creato tutte le diverse specie, perché usare sempre le stesse parti di base in diverse creature per funzioni diverse? Perché non utilizzare parti completamente nuove appositamente progettate per scopi specifici e diversi?
Sicuramente una "mano più perfetta" e una "pinna più perfetta" potrebbero essere create se basate su parti progettate per il loro scopo specifico. Invece, ciò che abbiamo in realtà sono parti del corpo imperfette e sono in parte imperfette perché derivano tutte da ossa originariamente esistite per altri motivi. Le ossa furono adattate, per lunghi periodi di tempo, per nuovi scopi a cui avevano bisogno per riuscirci a malapena. L'evoluzione richiede solo che uno sia migliore dei concorrenti, non che sia il migliore teoricamente possibile. Questo è il motivo per cui caratteristiche e strutture imperfette sono la norma nel mondo naturale.
È un dato di fatto, si può dire che l'intero mondo biologico sia composto da strutture omologhe: tutta la vita si basa sugli stessi tipi di nucleotidi e gli stessi amminoacidi. Perché? Un designer perfetto e intelligente potrebbe facilmente creare la vita da una varietà di aminoacidi e strutture di DNA, tutti specificamente adatti per scopi particolari. La presenza delle stesse strutture chimiche in tutta la vita è la prova che tutta la vita è correlata e sviluppata da un antenato comune. Le prove scientifiche sono inequivocabili: nessun dio o altri designer hanno avuto una mano nello sviluppo della vita in generale o della vita umana in particolare. Siamo ciò che siamo a causa della nostra eredità evolutiva, non a causa dei desideri o della volontà di qualsiasi divinità.
